含磷有机质的矿质化
土壤有机质中的磷主要存在于核蛋白、核酸、磷脂等有机化合物中，它们在微生物酶的作用下，逐渐把磷释放出来，并形成可溶性磷酸或磷酸盐存在于土壤中。
土壤中的磷只有以H2PQr或HPor的形式存在时才可被植物吸收利用，成为土壤速效磷。但是土壤中的速效磷往往转化为难溶性磷，导致土壤速效磷缺乏。在pH大于7的土壤中常富含Ca2+,有效磷往往与Ca2+结合，形成不溶性磷酸钙；在pH小于5的酸性土壤中常富含Fe3+,AP+,有效磷会与Fe3+,AP+相结合，形成不溶性磷酸铁和磷酸铝，这种导致土壤速效磷转化为难溶磷的过程，称为磷的化学固定作用。只有土壤呈中性或微酸性反应时，磷的有效性最高。磷的固定作用不利于植物生长，通过调节土壤的pH可以减少磷的固定作用。
含硫有机质的矿质化
含硫有机质是土壤硫元素的重要来源，有机质中的硫主要存在于含硫蛋白质中。含硫有机质的矿质化过程首先要经含硫蛋白质的水解，形成含硫氨基酸，如胱氨酸、磺氨酸等，桂花树种植然后分解出硫化氢。硫化氢在好气性细菌的作用下发生氧化，形成硫酸，这个过程称为硫化作用，即含硫蛋白质—含硫氨基酸—H2S2H2S+02—S2+2H20+热量S2+2H20+302—H2SO4+热量硫化作用使土壤中产生硫酸盐，可以为植物提供速效硫。但是，热带滨海土壤的水稻田中，因硫化作用会形成强酸性的土壤。在通气不良的土壤中，硫酸盐可以被还原为H2S,这一过程称为反硫化作用，反硫化作用对植物生长不利。
与此同时，存在于土壤有机质中的各种微量元素，也随上述分解过程释放出来。-总之，土壤有机质中的营养元素，需通过上述的化学和生物化学过程，才能得到释放。这些过程受地理环境条件，土壤的物质组成，土壤PH,土壤Eh以及土壤水热状况的综合影响，土壤的上述条件不同，植物养分在土壤中转化的特点也必有差异。
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